交通运输部的情况与之类似。五名副部长中，李家祥、高宏峰此前任民航总局的正副局长，翁孟勇、冯正霖、徐祖远三人是交通部副部长。这对于改革后继续衔接好原来两大行业的工作非常重要。

环保部沿用原班人马

　　环境保护部、住房和城乡建设部基本沿用环保总局、建设部的原班人马。除之前环保总局局长周生贤获委为环境保护部部长外，五位副局长潘岳、张力军、吴晓青、周建、李干杰同时获任命为环保部副部长。而原建设部的三名副部长仇保兴、黄卫、齐骥则被任命为住房和城乡建设部副部长，另一名新任副部长是原国务院信息化办公室副主任陈戴维。

　　根据机构改革方案，国家食品药品监督管理局划归卫生部管理，因此药监局局长邵明立被任命为卫生部副部长，旨在加强部局之间的统筹协调。

四国家局局长全是兼任

　　四个新组建的国家局第一任局长也同时揭晓，而且全部是兼任。包括国家发改委副主任张国宝兼任国家能源局局长，工业和信息化部副部长陈求发兼任国家国防科技工业局局长，人力资源和社会保障部部长尹蔚民兼任国家公务员局局长，交通运输部副部长李家祥兼任国家民用航空局局长。

　　另据了解，一些副部级高官将在国家局中担任要职。如原国防科工委副主任孙来燕担任国防科工局副局长，人力资源和社会保障部副部长杨士秋兼任国家公务员局党组书记、副局长。

　　其它的任命还有，王君接替李毅中出任国家安全生产监督管理总局局长，盛光祖接替牟新生出任海关总署署长。免去张平的国务院副秘书长职务、欧新黔的发改委副主任职务、李传卿的国家质检总局副局长职务。