据郑新立透露，此番机构改革方案所涉及的部委，当前已基本完成“三定”（定职能、定机构、定编制）方案。各部委在完成“三定”方案之后，需先上报中编办，由中编办协调更改之后，再报国务院审批。他预计，“三定”方案最快也得上半年，才能全部审批完毕。“方案经过国务院审批后，相关人员才能到位。”

　　他并指出，此番机构改革不是简单的机构成立与裁撤，而是着重彼此职能的重新集成。因此，凸显出来的协调与磨合之难，也在所难免。“这更证明，中央此次放弃‘一步到位’，采用‘分步走’的办法是正确的。分块推进，比一步到位效果要好得多。”他强调，当前最主要的，是尽快将所涉及部委的职能、机构、编制确定下来，使大部制尽快进入实质性操作状态。

　　中国改革杂志社学术顾问、著名未来战略专家武建东则坦言，此次机构改革涉及人员众多，不少人的工作和岗位都会被改变，甚至会有人因此离开部委。要解决这么多敏感而棘手的人事问题，确实不容易。“这正是当前‘三定’方案之所以谨慎、低调的原因。”

　　他亦指出，“三定”方案中，“定职能”这一关尤其重要。“部委在确定职能时要尽可能少而精，并尽可能将决策、执行和监督职能分开，否则，职能臃肿与机构臃肿的后果没什么区别。”

　　武建东认为：“如果这次‘定职能’时，还不能把原来相关部委里一些过宽过多的职能脱离出来，则此番改革所强调的优化政府职能、规范机构设置等目标，也很难实现，大部门管理体制亦将是一纸空谈。”